• Python & Nextflow: Umiejętność krytycznej oceny, refaktoryzacji i optymalizacji kodu generowanego przy wsparciu narzędzi genAI. Skupiamy się na jakości architektury, modularności i testowaniu.

• Doświadczenie w pisaniu testów (pytest, nf-test) oraz rygorystycznym podejściu do code review (kod pisany przy współudziale genAI).

• Doświadczenie w analizie danych z sekwencjonowania DNA (WGS, WES, Targeted). Praktyczna znajomość formatów plikowych (FASTQ, BAM, VCF) oraz standardowych narzędzi (BWA, GATK, SAMtools, BCFtools, VEP).

• Umiejętność budowania pipelinów bioinformatycznych działających w infrastrukturze chmurowej (GCP, AWS).

• Biegłość w obsłudze narzędzi Docker, Linux CLI, Git.

Mile widziane:

• Praktyczna znajomość środowiska Google Cloud (GCS, Batch, Kubernetes).

• Umiejętność pisania pipelinów w WDL / Cromwell.

• Doświadczenie z technologiami CI/CD (np. GitHub Actions).

• Podstawowa wiedza z zakresu genetyki / biologii molekularnej.